水处理紫外线杀菌器的作用主要是对水进行消毒和净化，其主要功能包括：
高效杀菌：紫外线对细菌、病毒的杀菌使用一般在一至二秒即可达到99%－99.9%的杀菌率。
高效杀菌广谱性：紫外线杀菌的广谱性高，它对几乎所有的细菌、病毒都能高效率杀灭。
无二次污染：紫外线杀菌不加入任何化学药剂，因此它不会对水体和周围环境产生二次污染，不改变水中任何成分。
运行安全、可靠：传统的消毒技术如采用氯化物或臭氧，其消毒剂本身就是属于剧毒、易燃的物质，而紫外线消毒系统不存在这样的安全隐患。
运行维护费用低：紫外线杀菌设备占地小，构筑物要求简单，因此总投资较少，在运行方面成本也较低，在千吨水处理量水平，它的成本只是氯消毒的1/2。
此外，紫外线杀菌器在管道直饮水系统中也有重要作用。管道直饮水系统是一种通过管道将自来水或其他水源直接供应给用户的系统，而紫外线杀菌器可以用于对这些供水管道中的水进行消毒和杀菌处理。在管道直饮水系统中，自来水或其他水源可能会受到细菌、病毒和其他微生物的污染。这些微生物可能来自水源本身、管道污染、维护不当或其他因素。如果未对水进行适当的消毒和杀菌处理，这些微生物可能会对人体健康造成潜在的风险。紫外线杀菌器通过将水流经过紫外灯管区域，利用UV-C波段的紫外线辐射来灭活或杀死水中的细菌、病毒和其他微生物。紫外线照射会破坏这些微生物的核酸结构，使其无法繁殖和生长，从而有效地杀灭这些微生物。
