强磁水处理对流体的作用是多方面的，其原理是使水以一定的流速切割磁力线的方式对水进行处理，通过磁场的作用降低了水的表面张力，增加水中离子的电导率，缓冲PH值使之趋向于中性等等。水的导体，当水流经于一个适当聚集的磁场时，将产生一个电动势，这个电动势将使水带上直流正电荷而互相排斥、分离，这导致水的表面张力大大降低，从而使水具有溶解性，这样水能溶解更多物质，起防垢作用，水溶解性的加大也使水能溶解那些已结的水垢，起除垢的作用。
由于磁场作用，水感应出正电荷，将水中过剩的氢离子和氢根离子束缚起来，减少PH值的波动，杜绝了电解腐蚀；负电性的管道形成阴极性保护，也有效的防止管道腐蚀。
在外超磁场的作用下，水作用为电解质，在水中形成电流，由于电流的存在使活性氧增加，使细胞壁变薄，细胞液流失，破坏了水中细菌、藻类微生物赖以生存的电磁环境而导致细菌和藻类的死亡，达到杀菌灭藻的功能。
